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50分子互作基础 1.确定ROS铁死亡系统的相互作用分子 通过SFB标签抗体,进行IP-MS和IP-WB发现PHLDA2与ALOX12互作(图1a、b)。进一步通过内源抗体Co-IP双向验证PHLDA2与ALOX12存在相互作用(图1c-d)。而免疫荧光共定位实验发现PHLDA2和ALOX12能够同时共定位于细胞质(图1e),进一步佐证了PHLDA2-ALOX12复合体的存在。 2.确定PHLDA2和ALOX12互作特异性 PHLDA2属于PH样结构域家族A,包括PHLDA1、PHLDA2和PHLDA3(图1f)。Co-IP实验分析发现,PHLDA1、PHLDA2和PHLDA3中,只有PHLDA2与ALOX12相05大家好,今天跟大家分享一篇题为Single-cell multi-omics analysis of lineage develo pment and spatial organi zation in the human fetal cere bellum(人胎儿小脑谱系发育和空间组织的单细胞多组学分析)人类小脑包含大量神经元,表现出与大脑不同的发育模式。几乎所有种类的脊椎动物成熟的小脑都具有三层,即分子层(ML)、浦肯野细胞层(PCL)和颗粒细胞层(GCL)。 01 研究背景 人类小脑包含许多神经元,表现出与大脑不同的发育范式。在这里,我们对孕周 (GW) 13 至 18 的胎儿样0哈喽!今天小编给推荐新西兰医学-药学类期刊 Interna tional Journal of Nanome dicine 创刊于2006年,2007年获得第一个影响因子,由国际著名出版商DOVE MEDICAL PRESS LTD出版,发表关于纳米技术在生物医学领域应用的各个方面。 期刊推荐 Grain Rain International Journal of Nanomedicine ISSN:1178-2013 1 期刊简介 《国际纳米医学杂志》是一本国际性的、同行评审的、开放获取的期刊,报道了整个生物医学领域纳米技术应用的各个方面。 本杂志反映了这一新兴和快速发展的研究领0000泛素修饰类型的作用:K6:与DNA损伤、线粒体稳态等相关。参与调控细胞周期、蛋白质定位和信号传导等过程。 K11:参与内质网介导的降解途径和细胞周期进程的控制。在细胞分裂和转录因子活性调控中发挥重要作用。 K27:在固有免疫、蛋白稳态和DNA损伤修复等方面具有功能。参与线粒体自噬和信号转导等过程。 K29:调控蛋白质的溶酶体降解,与蛋白酶体应激反应相关。参与调控蛋白质的细胞定位和信号传导。 K33:与先天免疫有关,可能在免疫细胞0大家好,今天跟大家分享一篇题为 Neuroligin 1 Regulates Autistic-Like Repetitive Behavio rthrough Modulating the Activity of Striatal D2Receptor-Expressing Medium Spiny Neurons(Neuroligin 1通过调节表达纹状体D2受体的中棘神经元的活性来调节自闭症样重复行为)限制和重复行为 (RRB) 是自闭症谱系障碍 (ASD) 的主要症状,对个人健康构成重大风险。然而,RRB 产生背后的特定细胞和神经回路机制仍不清楚。 01 研究背景 生物衰老可以定义为分子和细胞功能各个方面的限制和重复行为0哈喽!今天小编给推荐 Journal Of Cellular Physiology 是一本以生物-生理学综合研究为特色的国际期刊。该刊由WILEY出版商创刊于1966年,刊期Monthly。期刊聚焦生物-生理学领域的重点研究和前沿进展,及时刊载和报道该领域的研究成果,致力于成为该领域同行进行快速学术交流的信息窗口与平台。 期刊推荐 Grain Rain JOURNAL OF CELLULAR PHYSIOLOGY ISSN:0021-9541 1 期刊简介 Journal of Cellular Physiology 在真核细胞生物学和生理学领域发表高质量的原始研究文章和评论,重点000000第一步,筛选CARM1的互作蛋白 通过anti-Flag-CARM1 IP-MS鉴定与CARM1相互作用的蛋白,分析显示CARM1与HIF1A存在关联(图1a)。 第二步,验证CARM1与HIF1A相互作用 在常氧和缺氧条件下,进行Co-IP分析,CARM1和HIF1A相互作用(图1b-e)。此外,GST pulldown实验也证实CARM1与HIF1A互作(图1f-g)。 第三步,确定CARM1与HIF1A互作具体位置 构建截短载体GST-CARM1-EVH1结构域(1-140 aa)、GST-CARM1-cat(141-480 aa)和GST-CARM1-c(481-608 aa),进行GST pulldown实验,表明CARM1的EVH1结构域负责与HIF10迄今,临床上仍有大量疾病缺乏安全有效的治疗药物。因此,药物创新研究的重要性日益凸显。中药虽然在临床预防治疗复杂疾病方面具有其特色和优势,但是中药有效成分及其作用靶点、机制不明确等问题仍然是中药现代化的阻碍因素,也是中药发展和走向世界的主要瓶颈之一。 2022年8月,北京大学药学院屠鹏飞/曾克武团队在Science Advances(IF=11.7)上发表题为“Neuroinflammation inhibition by small-molecule targeting USP7 noncatalytic domain for neurodegenerative disease thera00通过anti-CARM1 ChIP-seq实验,共鉴定出17,749个carm1特异性结合峰和4,866个独特的启动子基因(图1a)。KEGG分析发现,这些基因参与HIF-1、Wnt、VEGF等信号通路(图1b)。ChIP-qpcr检测显示,CARM1在CARM1、CDK4、Cyclin D1、β-Catenin、HIF1A、MALAT1, MAT2A、VEGFA和Vimentin等启动子上强富集,验证了ChIP-seq结果(图1c)。对所选基因进行anti-H3R17me2a和anti-H3R26me2a ChIP-qpcr分析,显示H3R17me2a和H3R26me2a占据了目标启动子(图1d)。进一步表明,这些启动子被CARM1占据。 敲减CARM1进行RNA-seq0做的是去除含硫化氢岩石中的硫化氢实验 需要将硫化氢吸附到岩石中 但是硫化氢气体有毒 就想着能不能通过一种溶液来代替硫化氢气体做实验0000THC结合TRIP13抑制TRIP13/USP7/c-FLIP三元复合物相互作用介导c-FLIP泛素化 研究THC处理后TRIP13、c-FLIP和USP7之间的相互作用。Co-IP实验显示c-FLIP、TRIP13和USP7直接结合在一起,THC抑制了它们在TNBC细胞中的结合能力(图3f)。此外,分子对接和分子动力学分析表明,USP7、TRIP13和c-FLIP形成三元配合物,其中TRIP13是连接c-FLIP和USP7的桥梁;THC通过与ASP89和ASP84的氢键与TRIP13相互作用(图1g)。另外,THC的加入削弱了USP7、TRIP13和c-FLIP之间的总结合能和氢键相互作用(图1h-i)0THC结合TRIP13抑制TRIP13/USP7/c-FLIP三元复合物相互作用介导c-FLIP泛素化 研究THC处理后TRIP13、c-FLIP和USP7之间的相互作用。Co-IP实验显示c-FLIP、TRIP13和USP7直接结合在一起,THC抑制了它们在TNBC细胞中的结合能力(图3f)。此外,分子对接和分子动力学分析表明,USP7、TRIP13和c-FLIP形成三元配合物,其中TRIP13是连接c-FLIP和USP7的桥梁;THC通过与ASP89和ASP84的氢键与TRIP13相互作用(图1g)。另外,THC的加入削弱了USP7、TRIP13和c-FLIP之间的总结合能和氢键相互作用(图1h-i)0000000大家好,今天跟大家分享一篇题为PRMT6 Epigene tically Drives Metabolic Switch from Fatty AcidOxi dation toward Glycolysis and Promotes Osteoclast Differen tiation During Osteo porosis(PRMT6在表观遗传学上驱动从脂肪酸氧化到糖酵解的代谢转换,并促进骨质疏松症期间破骨细胞的分化)代谢重编程是指细胞为了应对各种刺激压力而进行的代谢调整,普遍存在于多种疾病中,涉及到糖代谢、脂代谢、氨基酸代谢等代谢通路,与疾病的发生发展密切相关。 01 研究背景 新陈代谢的表观遗传0000000大家好,今天跟大家分享一篇2024年9月16日,中山大学生命科学学院金寿恒副教授在国际期刊 The EMBO Journal 上在线发表了题为 ER-phagy restrains inflam matory responses through its receptor UBAC2 的研究论文,该研究鉴定出UBAC2 蛋白作为 ER - phagy 的新受体,当细胞处于 ER 应激或自噬激活的状态时,MARK2使 UBAC2 磷酸化并二聚化,进而增强其与GABARAP的相互作用,从而促进了内质网的选择性降解。 01 研究背景 内质网自噬是内质网 (ER) 片段自噬降解的一种选择性形式,在000ChIRP-MS和RNA pulldown-WB实验,发现AZGP1, DSG1和KRT16证明与circNOLC1存在互作(图1a-c)。因AZGP1在CRC中高表达,且在葡萄糖代谢中发挥重要作用,故将其作为研究对象。RIP实验发现circNOLC1在anti-AZGP1下拉物中显著富集(图1d)。为了确定circNOLC1与AZGP1互作区域,设计circNOLC1缺失突变体,进行RNA pulldown实验,表明circNOLC1的nt 91-150是circNOLC1与AZGP1相互作用必需的(图1e)。 进一步检测发现,circNOLC1仅调控AZGP1蛋白水平,用蛋白酶体抑制剂处理细胞显示MG132显著提高AZGP100000